1.中華民國 88 年 10 月 27 日行政院農業委員會（88）農人字第 8808
  0582 號函修正頒布
2.中華民國 93 年 4  月 30 日行政院農業委員會農人字第 0930080593 
  號函修正頒布
3.中華民國 97 年 3  月 19 日行政院農業委員會農人字第 0970080209 
  號函修正頒布全文 3 點 
4.中華民國 98 年 6  月 1  日行政院農業委員會農人字第 0980080554
  號函修正頒布權責劃分表－共同事項
5.中華民國 101  年 6  月 29 日行政院農業委員會農人字第 10107250
  23 號函修正頒布貳、權責劃分表(共同事項)第三點規定
6.中華民國 104  年 5  月 18 日行政院農業委員會農人字第 10401124
  74 號函修正頒布參、個別事項三、動植物防疫檢疫局，並自即日生效
7.中華民國 105  年 1  月 15 日行政院農業委員會農人字第 10401133
  50 號函修正頒布全文 3 點；並自中華民國105年1月15日生效
8.中華民國 106  年 5  月 19 日行政院農業委員會農人字第 10601124
  66 號函修正頒布附表；並自即日生效
9.中華民國 109  年 8  月 19 日行政院農業委員會農人字第 10901128
  30 號函修正頒布附表貳、權責劃分表─共同部分四、人事部分第 3 點；
  並自即日生效
10.中華民國 110  年 1  月 15 日行政院農業委員會農人字第 1090112
   985 號函修正頒布附表參、權責劃分表-個別事項第 13 點；並自 10
   9  年 10 月 1  日生效
11.中華民國 113  年 1  月 11 日行政院農業委員會農人字第 1120113
   749 號函修正頒布全文 2  點，並修正名稱為「農業部與所屬機關（
   構）權責劃分表」