41.	109.05.20	養殖漁業生產調節獎勵作業規範	行政規則
42.	109.03.25	核發國產養殖蝦產品輸銷美國來源聲明書作業規範	行政規則
43.	108.03.12	養殖漁業公共建設補助及維護管理要點	行政規則
44.	108.01.25	申請及核發未經加工與經加工養殖水產品輸銷大陸地區魚貨來源及衛生證明文件作業要點	行政規則
45.	106.08.01	輸入幼鰻檢驗要點	行政規則
46.	106.06.30	臺灣水產品生產追溯管理作業規範	行政規則
47.	106.06.20	輸銷歐盟漁獲物魚市場及卸魚場衛生管理作業要點	行政規則
48.	105.10.26	歐盟登錄水產飼料加工廠管理作業要點	行政規則
49.	105.03.24	輸歐盟漁產品養殖場登錄管理作業要點	行政規則
50.	105.01.27	基因轉殖水產動植物田間試驗管理規則	命令