1.中華民國 56 年 8 月 12 日總統（56）台統（一）義字第 642 號令制
定公布全文 43 條
2.中華民國 85 年 1 月 31 日總統（85）華總字第 8500023540 號令修
正公布全文 48 條及其名稱（原名稱：家畜傳染病防治條例）
3.中華民國 89 年 5 月 17 日總統（89）華總一義字第 8900118920 號
令修正公布第 2、6、8、12、13、18、28～31、40 條條文
4.中華民國 90 年 11 月 7 日總統（90）華總一義字第 9000217670 號
令修正公布第 28 條條文
5.中華民國 91 年 2 月 6 日總統華總一義字第 09100021370 號令修正
公布第 12、13、22、31、32、34、35、39、41～45 條條文；並增訂第
13-1、32-1、34-1、38-1 條條文
6.中華民國 91 年 5 月 29 日總統華總一義字第 09100108380 號令增訂
公布第 10-1 條條文
7.中華民國 95 年 5 月 24 日總統華總一義字第 09500074961 號令修正
公布第 41 條條文；並增訂第 41-1 條條文
8.中華民國 97 年 12 月 10 日總統華總一義字第 09700265281 號令修
正公布第 9、16、32、34、34-1、39、41、42～44、46 條條文；增訂
第 45-1 條條文；並刪除第 11 條條文
9.中華民國 98 年 1 月 23 日總統華總一義字第 09800015931 號令修正
公布第 9 條條文
10.中華民國 103 年 6 月 4 日總統華總一義字第 10300086001 號令修
正公布第 17、20 條條文
11.中華民國 103 年 12 月 24 日總統華總一義字第 10300194131 號令
修正公布第 14、19、28、40、43、45 條條文並增訂第 12-1、12-2、
14-1 條條文
12.中華民國 107 年 12 月 12 日總統華總一經字第 10700137531 號令
修正公布第 45-1 條條文
13.中華民國 108 年 1 月 4 日總統華總一經字第 10800001311 號令修
正公布第 34 條條文
14.中華民國 108 年 12 月 13 日總統華總一經字第 10800137701 號令
修正公布第 5、12-2、16、32 ～34-1、35、36、38、38-1、39、41～
45、47 條條文；增訂第 10-2 、34-2、34-3、38-2、38-3 條條文 ；
並刪除第 37 條條文
中華民國 112 年 7 月 27 日行政院院臺規字第 1125014346 號公告
第 2 條、第 4 條、第 5 條第 2 項、第 6 條第 1 項、第 8 條第
1 項、第 2 項、第 4 項、第 10-1 條、第 12 條第 2 項、第 12-1
條、第 12-2 條、第 13-1 條、第 14 條第 3 項、第 14-1 條、第
16 條第 1 項第 3 款、第 6 款、第 2 項第 3 款、第 3 項、第 17
條、第 18 條、第 20 條第 1 項、第 4 項、第 23 條、第 24 條、
第 28 條、第 30 條、第 31 條、第 32 條第 3 項、第 4 項、第
33 條、第 34-3 條第 2 項、第 39 條、第 40 條第 1 項第 6 款
、第 2 項、第 4 項、第 41-1 條第 3 項、第 43 條第 3 款、第
4 款、第 8 款、第 45 條第 3 款、第 6 款、第 47 條所列屬「行
政院農業委員會」 之權責事項，自 112 年 8 月 1 日起改由「農業
部」管轄；第 8 條第 2 項所列屬「動物防疫檢疫機關」之權責事項
原由 「行政院農業委員會動植物防疫檢疫局及所屬機關」 管轄，自
112 年 8 月 1 日起改由「農業部動植物防疫檢疫署及所屬機關」管
轄；第 8 條第 3 項、第 32 條、第 32-1 條第 1 項、第 2 項、第
33 條第 2 項、第 5 項、第 34 條第 1 項、第 3 項、第 4 項、第
34-1 條第 1 項、第 3 項、第 34-2 條第 1 項、第 34-3 條第 1
項、第 35 條第 4 項、第 36 條第 1 項、第 2 項、第 38 條、第
38-1 條、第 38-3 條、第 41 條第 2 項、第 42 條第 1 項第 3 款
、第 44 條第 6 款、第 45 條第 13 款、第 14 款、第 16 款、第
18 款、第 46 條所列屬「輸出入動物檢疫機關」之權責事項原由「
行政院農業委員會動植物防疫檢疫局及所屬機關」管轄，自 112 年
8 月 1 日起改由「農業部動植物防疫檢疫署及所屬機關」管轄